AERMOD可考虑NOx-NO2混合物在空气中的化学转化，当用户计算NO2的浓度时，AERMODSYSTEM 4.0为NOx转化提供了默认值（来源于AERMOD导则）。如果用户不考虑NOx转化，则计算过程认为NOx将全部转化为NO2。
在AERMODSYSTEM 中考虑转化作用的方法如下：
1、设置NOx转化选项
需要注意的是，软件对NOx转化进行了限制，只有当用户选择预测“NO2”时，“考虑NOx转化”才会有效，其它污染物不能对这个选项进行控制。
在“控制选项”对话框中选中污染物“NO2”后，再选中“模型选项”中的“考虑NOx转化”复选框。
2、设置NOx转化方法
软件提供了两种计算方法：
1）臭氧浓度限值方法（OLM）：需要设置污染源排放的污染物中NO2/NOx的比例和环境中的臭氧浓度
2）烟团质量比方法（PVMRM）：污染源排放的污染物中NO2/NOx的比例、环境空气中达到平衡时的比例、环境中的臭氧浓度。注意，如果臭氧浓度相对污染物浓度较高时，将全部转化为NO2。
对于一般的燃烧设备，在计算小时或日平均浓度时，可以假定环境中NO2/NOx=0.9；在计算年平均浓度时，可以假定NO2/NOx=0.75。
在计算机动车排放NO2 和NOX 比例时，应根据不同车型的实际情况而定。
3、设置环境中臭氧浓度
环境中的臭氧浓度在“NOX转化”选项卡中设置。软件中设置了环境中臭氧的默认浓度为40ppb，这是“AERMOD导则”中提供的默认值。
如果有臭氧浓度的小时数据，用户可以指定一个每小时的臭氧数据文件，设置臭氧的浓度单位，导入AERMOD默认格式(OZO)的数据文件；选中“自定义文件格式”即可以导入自定义格式的臭氧数据文件。如果设置了小时浓度值，同时也设置环境默认浓度，数据文件中的缺失数据由臭氧浓度值代替。
如果环境臭氧浓度值呈现周期性变化，用户也可以根据周期变化规律选择相应的变化周期，并设置臭氧的排放系数(以设置的臭氧浓度值为基准)。
4、设置每个污染源排放的NOx/NO2比例
用户可以为每个污染源设置排放的NOx/NO2比例，默认值0.1。设置方法为逐个打开污染源详细参数对话框，“在NOX转化”选项卡中设置。
